Para esto debes ingresar a Configuración → Cajas, abrir la configuración de la caja dando clic en su código y posteriormente dar clic en Eliminar.
Si la cuenta contable seleccionada tiene transacciones asociadas o movimientos en el sistema, este te muestra un mensaje como el siguiente:
En este caso podrás Suspender o Retirar la caja para que no se haga uso de esta en futuros movimientos, solo debes cambiar su Estado en la parte inferior de su configuración.